学霸的模拟器系统 第158节

　　“成功了……”

　　程新竹捂住嘴，声音里带着一丝颤音。

　　那条红色的轨迹，就是他们梦寐以求的，蛋白质错误折叠的路径！

　　“等等，”

　　林允宁没有庆祝，他指着屏幕上那条轨迹的中间某个位置，“你看这里。”

　　他将那部分区域放大。

　　只见在那段平滑的轨迹上，有一个极其突兀的“尖峰”。

　　“这是什么？”

　　程新竹凑了过去。

　　“能量势垒。”

　　林允宁调出了轨迹对应的能量变化曲线，“蛋白质在折叠到这里时，需要克服一个巨大的能量障碍才能继续往下走。

　　“换句话说，这是一个能量极不稳定的‘过渡态’结构。”

　　他敲了几个命令，将这个过渡态对应的三维结构单独渲染了出来。

　　屏幕上，一个由无数原子构成的、结构极其扭曲的蛋白质模型，静静地悬浮着。

　　程新竹看着那个模型，呼吸猛地一滞。

　　“等等……这个形状……β折叠片在这里发生了致命的错位……它就像一个结构上的‘瓶颈’！”

　　她猛地抬起头，看着林允宁，眼神里爆发出难以置信的狂喜。

　　“它就是那个中间体，药物设计的完美靶点！”

　　林允宁冷静地看着屏幕，点了点头。

　　“而且，”

　　他指着能量曲线上另外几个稍小的尖峰，“很可能不只一个。”

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第143章 拓扑记忆（求订阅求月票）

　　程新竹看着屏幕上那条代表着希望的红色轨迹，激动得脸颊通红。

　　她恨不得现在就抱着笔记本冲回医学院，把这份结果拍在格林伯格教授的办公桌上。

　　“走！我们现在就去找我老板！”

　　她从椅子上弹起来，伸手就要去拔笔记本的电源，“有了这个，他肯定会把计算集群的权限还给我们！”

　　“等等。”

　　林允宁按住了她的手，摇了摇头。

　　“怎么了？”

　　程新竹不解地看着他，像一只刚要扑向毛线球却被按住爪子的小猫。

　　“现在还不够。”

　　林允宁的语气很平静，“这只是一千张图跑出来的初步结果，在格林伯格那种级别的学者眼里，这最多算是一个‘有趣的猜想’。

　　“他肯定会问一百个问题来质疑这个结果的可靠性：你的算法收敛性怎么样？对初始参数敏不敏感？有没有做过交叉验证？”

　　他看着程新竹，很认真地说：

　　“我们要么不做，要么就做一份让他无可辩驳的结果。

　　“我们需要用全部的数据，跑出完整的路径网络，并且找到所有关键的过渡态结构。

　　“我们要的不是一张地图草稿，而是一份完整的、带有等高线和地标的全景图。”

　　程新竹脸上的兴奋慢慢冷却下来，她知道林允宁说得对。

　　在学术界，一个初步的、漂亮的结果，和一份扎实的、经过反复验证的工作，分量完全不同。

　　“可我们没有计算资源了，”

　　她垮下脸，声音又小了下去，“那台Beowulf集群，一个节点的机时费就要好几十美元……”

　　“不需要集群。”

　　林允宁把笔记本转回来，“我优化了算法的核心，砍掉了所有不必要的计算。

　　“理论上，找一台你们实验室性能最好的台式机，比如做图像处理的那种戴尔工作站，大概一周时间，就能跑完。”

　　他打开一个文本文件，里面是几行简洁的命令行代码。

　　“这是启动脚本，所有参数我都设好了。

　　你只需要把数据路径改一下，然后敲回车就行。”

　　他把使用方法和注意事项仔细地教给程新竹。

　　程新竹凑在旁边，看着屏幕上那些对她来说如同天书的代码，用力地点了点头，眼神里重新燃起了斗志。

　　“好！我明天就去‘借用’一下师兄那台新配的电脑！你等我好消息！”

　　在等待蛋白质算法结果的同时，林允宁将“反推”的思路带回了物理系。

　　这时，实验室里气氛有些沉闷。

　　埃米特·卡特正站在那块巨大的白板前，眉头紧锁，手里捏着一支快没水的记号笔，在已经写满了公式的白板上烦躁地划拉着。

　　他之前提出的那个“有效模型”，卡住了。

　　无论他怎么修正参数，调整近似条件，算出来的电导曲线，都和玛利亚的实验数据对不上。

　　要么平台的高度不对，要么磁滞回线的形状是错的。

　　玛利亚坐在一旁，轻手轻脚地剥着一个桔子，大气也不敢出。

　　理论物理是她的弱项，在埃米特面前，她确实帮不上什么忙。

　　“嘿，伙计们。”

　　林允宁推门进来，手里还端着一杯从神学院地下室买来的咖啡。

　　“你来得正好，”

　　埃米特看到他，像是看到了救兵，又像是找到了一个倾诉对象。

　　他把记号笔往桌上一扔，揉着太阳穴，“我的模型失败了。它根本无法重现那个该死的磁滞回线。”

　　林允宁走到白板前，看了一眼上面密密麻麻的推导，然后又看了看旁边贴着的实验数据图。

　　“埃米特，”

　　他开口道，“也许我们从一开始就想错了。”

　　“什么意思？”

　　“我们一直试图用样品里的缺陷、无序这些‘脏东西’来解释这个记忆效应，”

　　林允宁拿起一支红笔，在实验图那条干净的磁滞回线上画了个圈，“但你看这条曲线，它非常稳定，重复性极好。如果真是由随机分布的缺陷导致的，结果应该每次都不太一样才对。”

　　他看着埃米特和玛利亚，提出了一个这几天在他脑中逐渐成型的惊人假设：

　　“有没有可能，这个记忆效应，和样品本身干不干净，毫无关系？它不是一种‘缺陷态’，而是一种内禀的、由几何结构决定的‘拓扑记忆’？”

　　“拓扑记忆？”

　　埃米特皱起了眉，这个词他闻所未闻。

　　“对。”

　　林允宁的思路异常清晰，“扭转的几何结构，在动量空间中创造了一个极其复杂的非阿贝尔规范场。电子在里面运动，就像走迷宫。

　　“你从左边进去和从右边进去，走的路径不一样，最终到达的量子态也就不一样。这个‘记忆’，是写在动量空间的几何结构里的，是内禀属性，擦不掉的。”

　　玛利亚听得似懂非懂，但她抓住了关键：

　　“你的意思是……这个效应，是这种‘魔角石墨烯’自带的？”

　　“完全正确。”

　　埃米特则抱着手臂，在白板前来回踱步，眼神里闪烁着怀疑和思考。

　　“这个图像很美，林。但它只是个图像，你怎么证明它？”

　　他停下脚步，直视着林允宁，“你怎么把这个‘迷宫’，和一个可以测量的物理量联系起来？”

　　“我们可以做一个‘泵浦-探测’实验。”林允宁回答。

　　他拿起笔，在白板的空白处画了一个简单的脉冲示意图。

　　“我们用一个特定的电压脉冲序列，去‘写入’信息。比如，一个先正后负的脉冲，就代表‘0’。反过来，先负后正，就代表‘1’。”

　　“然后呢？”玛利亚问。

　　“然后我们撤掉脉冲，用一个很小的直流电压去测量样品的电阻。

　　“如果我的理论是对的，两种不同的‘写入’方式，会让电子陷入动量空间迷宫里两个不同的拓扑态，从而对应两个完全不同的、稳定的电阻值。

　　“我们就能通过测量电阻，来‘读取’我们刚刚写入的信息。”

　　这个实验方案，构思极其精巧，但操作上却并不复杂。

　　玛利亚的眼睛瞬间亮了。

　　“这……这我们现在就能做！”

　　她扔掉桔子皮，将一整个桔子直接塞进了嘴里，兴奋地站起来，“低温恒温器还开着，样品也在里面，我们只需要改一下测量程序！”

　　埃米特看着白板上那个简洁的实验方案，沉默了。

　　这个设计，完美地将一个抽象的拓扑学概念，和一个干净利落的电学测量联系在了一起。

　　如果成功，将是无可辩驳的证据。

　　他深吸一口气，看向林允宁，眼神里也闪烁出了兴奋。

　　那是一种对即将验证新物理现象的期待和激动。